Расследуючы чарговую справу, герой гульні Mystery Subway Escape 2 - дэтэктыў Майкл, знайшоў таемны ўваход на закінутыя станцыі метро. Аб іх мала хто ведае. Гаворка ідзе не пра тэхнічныя тунэлі, менавіта пра станцыі, якія калісьці былі дзейнымі, але па тых ці іншых прычынах аказаліся зачыненымі і незапатрабаванымі. Там засталося сякая-такая абсталяванне, рэчы і прадметы, якія не выкінулі таму, што могуць яшчэ спатрэбіцца. Менавіта тамака і наш герой будзе шукаць доказы, а затым вынахад, паколькі дзверы, куды ён увайшоў, хтосьці замкнуў у Mystery Subway Escape 2. Мабыць за ім сачылі і вырашылі пазбавіцца ад скурпулёзнага шпіка.
