Зазірніце ў Грыбнае каралеўства, там зноў адбылося надзвычайнае здарэнне - выкрадзена прынцэса Персік. Але на гэты раз злосны Боузер ні прычым, як гэта не дзіўна. Небараку пацягнуў злосны прывід і паляцеў з закладніцай на цёмную бок зусім іншага свету, не належыць таго, дзе жыве Марыё. Адважнаму вадаправодчык прыйдзецца пераправіцца ў свет Майнкрафта і адшукаць выкрадальніка. Апынуўшыся на чужой тэрыторыі, Марыё стане падобным на блокавых насельнікаў і гэта не дзіўна, яму няма чаго вылучацца. Дапамажыце герою ў Super Mario MineCraft Runner прамчацца па доўгай дарожцы з перашкодамі, збіраючы манеты.