Існуе цэлы культ, дзе маленькія хлопчыкі вывучаюць мастацтва ніндзя. Гэта вельмі складаны шлях, які патрабуе не толькі добрай фізічнай падрыхтоўкі, але і сілы духу. Выконваць усе законы кодэкса ніндзя, можа не кожны. У гульні Ninja Boy, вы пазнаёміцеся з Кунам, хлопчыкам, які вырашыў прысвяціць сваё жыццё кодэксу ніндзя. Учора, на яго школу быў здзейснены напад. Тыя, хто нападаў, гэта не людзі, а нейкія, вельмі дзіўныя монстры. Яны выкралі ўсе скарбы школы ніндзя. Цяпер, толькі Кун можа вярнуць скрадзенае, але, яму патрэбна ваша дапамога. Вы павінны накіроўваць яго так, каб ён, за мінімальная колькасць хадоў, забіў монстраў і вярнуў скарбы.
